Ну да есть только две вселенные №1 и №2, но есть так же и два, минимум, сценария развития событий в этих вселенных, в одном из них Питер выжил на озере Рейден, но потом исчез при включении устройства, а в другом погиб на озере, но потом опять появился, вопреки сценарию, которого придерживаются наблюдатели (его сейчас нам и показывают). В сущности сейчас даже не альтернативная временная линия показывается, как предположила Nadin85, время всё тоже, а альтернативный сценарий развития событий ( как в фильме "Меняющие реальность"), возникающий из‑за Питера, который вносит хаос в порядок, являясь причиной возникновения альтернативных сценариев.
С самого начала была связка двух вселенных, назовём их №1 и №2, затем после включения устройства Питер исчез, но через некоторое время появился в новой связке вселенных, назовём их №3 и №4, поэтому теперь в этом сезоне он стремится вернуться в вселенную №1 из первой связки. Но похоже он всех Оливий оприходует :)